Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF488Q96MN9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms