Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI9

AGBL1, Cytosolic carboxypeptidase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL1Q96MI9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AGBL1Q96MI9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AGBL1Q96MI9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AGBL1Q96MI9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AGBL1Q96MI9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AGBL1Q96MI9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AGBL1Q96MI9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AGBL1Q96MI9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AGBL1Q96MI9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGBL1Q96MI9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGBL1Q96MI9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL1Q96MI9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms