Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCMTD1Q96MG8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PCMTD1Q96MG8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCMTD1Q96MG8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms