Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC138Q96M89 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC138Q96M89 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC138Q96M89 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms