Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C9orf72Q96LT7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf72Q96LT7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf72Q96LT7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf72Q96LT7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms