Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITCHQ96J02 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITCHQ96J02 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITCHQ96J02 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITCHQ96J02 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITCHQ96J02 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITCHQ96J02 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITCHQ96J02 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITCHQ96J02 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITCHQ96J02 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms