Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNF8Q96H20 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNF8Q96H20 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNF8Q96H20 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNF8Q96H20 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms