Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC97Q96F63 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC97Q96F63 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms