Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERP27Q96DN0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERP27Q96DN0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERP27Q96DN0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms