Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHISA4Q96DD7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHISA4Q96DD7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms