Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EME1Q96AY2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EME1Q96AY2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EME1Q96AY2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms