Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RERGQ96A58 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RERGQ96A58 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RERGQ96A58 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms