Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC10Q969S8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC10Q969S8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms