Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF34Q969K3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF34Q969K3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF34Q969K3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF34Q969K3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms