Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C6Q969F1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTF3C6Q969F1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C6Q969F1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTF3C6Q969F1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTF3C6Q969F1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
GTF3C6Q969F1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C6Q969F1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C6Q969F1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C6Q969F1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C6Q969F1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C6Q969F1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C6Q969F1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C6Q969F1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C6Q969F1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms