Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RABGGTAQ92696 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABGGTAQ92696 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABGGTAQ92696 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
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