Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP205Q92621 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP205Q92621 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP205Q92621 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP205Q92621 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms