Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SREK1Q8WXA9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREK1Q8WXA9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SREK1Q8WXA9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SREK1Q8WXA9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms