Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEPDC1BQ8WUY9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DEPDC1BQ8WUY9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEPDC1BQ8WUY9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms