Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTRT1Q8TDG2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTRT1Q8TDG2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTRT1Q8TDG2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms