Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG7

DENND6B, Protein DENND6B, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND6BQ8NEG7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND6BQ8NEG7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND6BQ8NEG7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND6BQ8NEG7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND6BQ8NEG7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND6BQ8NEG7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND6BQ8NEG7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms