Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIK3C3Q8NEB9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C3Q8NEB9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms