Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUMF1Q8NBK3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUMF1Q8NBK3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SUMF1Q8NBK3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUMF1Q8NBK3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUMF1Q8NBK3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUMF1Q8NBK3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUMF1Q8NBK3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUMF1Q8NBK3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUMF1Q8NBK3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUMF1Q8NBK3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUMF1Q8NBK3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUMF1Q8NBK3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SUMF1Q8NBK3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms