Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00337Q8N6G1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms