Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO39Q8N4B4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO39Q8N4B4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO39Q8N4B4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms