Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZT9

FAM9C, Protein FAM9C, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM9CQ8IZT9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM9CQ8IZT9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM9CQ8IZT9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM9CQ8IZT9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms