Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZT8

HS3ST5, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 5, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST5Q8IZT8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HS3ST5Q8IZT8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HS3ST5Q8IZT8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS3ST5Q8IZT8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms