Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CKAP2LQ8IYA6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CKAP2LQ8IYA6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CKAP2LQ8IYA6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CKAP2LQ8IYA6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CKAP2LQ8IYA6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP2LQ8IYA6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms