Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLF2Q8IX21 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLF2Q8IX21 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLF2Q8IX21 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms