Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCD3Q8IVD9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD3Q8IVD9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUDCD3Q8IVD9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms