Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUK5

PLXDC1, Plexin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1Q8IUK5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXDC1Q8IUK5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXDC1Q8IUK5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXDC1Q8IUK5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXDC1Q8IUK5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXDC1Q8IUK5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXDC1Q8IUK5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXDC1Q8IUK5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXDC1Q8IUK5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXDC1Q8IUK5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms