Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX29P2Q8IUI4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms