Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLNKQ7Z7G1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLNKQ7Z7G1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms