Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RD3Q7Z3Z2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RD3Q7Z3Z2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RD3Q7Z3Z2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RD3Q7Z3Z2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RD3Q7Z3Z2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RD3Q7Z3Z2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RD3Q7Z3Z2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RD3Q7Z3Z2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RD3Q7Z3Z2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RD3Q7Z3Z2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RD3Q7Z3Z2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms