Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX8Q7RTT4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms