Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRC3Q7RTR2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRC3Q7RTR2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms