Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
OTOP1Q7RTM1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
OTOP1Q7RTM1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms