Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP1BQ7LBR1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms