Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMUB2Q71RG4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB2Q71RG4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMUB2Q71RG4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMUB2Q71RG4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms