Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM136Q6ZRR5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM136Q6ZRR5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM136Q6ZRR5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms