Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB11FIP1Q6WKZ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP1Q6WKZ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms