Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms