Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

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Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TMEM53Q6P2H8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TMEM53Q6P2H8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM53Q6P2H8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TMEM53Q6P2H8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TMEM53Q6P2H8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM53Q6P2H8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM53Q6P2H8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM53Q6P2H8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM53Q6P2H8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM53Q6P2H8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM53Q6P2H8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM53Q6P2H8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM53Q6P2H8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM53Q6P2H8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM53Q6P2H8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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