Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1L6

ZNF343, Zinc finger protein 343, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF343Q6P1L6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF343Q6P1L6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF343Q6P1L6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF343Q6P1L6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms