Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC8EQ6NSJ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC8EQ6NSJ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms