Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIGD3Q6B0B8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIGD3Q6B0B8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TIGD3Q6B0B8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms