Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM68Q6AZZ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM68Q6AZZ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM68Q6AZZ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms