Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9BQ674R7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9BQ674R7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms