Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM236Q5W0B7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms