Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCERG1LQ5VWI1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCERG1LQ5VWI1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCERG1LQ5VWI1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCERG1LQ5VWI1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms